Madrasah Ibtidaiyah Negeri 2 Pulang Pisau (MIN 2 Pulang Pisau)   didirikan pada tahun 1994, berlokasi di Jl. Patih Rumbih Rt 003 Desa Maliku Baru Kecamatan Maliku Kab. Pulang Pisau. Pada mulanya madrasah  ini bernama adalah madrasah swasta bernama MIS Al Muhajirin yang didirikan oleh para tokoh agama dan masyarakat antara lain, Guru H Darlan, Bapak Lukman Chaniago, Suwarno, Bapak Asnawi dll,  kemudian berubah status menjadi  madrasah negeri bernama MIN Maliku Baru berdasarkan SK Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 515 Tahun 1995, tanggal 25 November 1995. Kemudian berubah nama menjadi MIN 2 Pulang Pisau berdasarkan SK Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 464 Tahun 2018, tanggal 16 Juli 2018.

        Lembaga pendidikan ini  adalah madrasah berstatus negeri yang pertama di wilayah kabupaten Pulang Pisau berupaya menyediakan pendidikan masyarakat di sekitar wilayah kecamatan Maliku yang tidak terjangkau oleh madrasah   lainnya.

         Adapun beberapa Kepala madrasah yang telah memimpin MIN 2 Pulang Pisau, yaitu pertama adalah Bapak M Darsi, pada periode 1995-1999, dilanjtutkan oleh Bapak Drs. H. Suriansah, M.Pd.I dari tahun 1999 – 2004, kemudian dilanjutkan oleh Bapak Mulyani, M.Pd.I pada periode 2008-2014, kemudian dilanjutkan oleh Bapak Zimmah Sari, S.Ag pada periode 2014-2018, selanjutnya Bapak Darmawi, S.Ag (alm) pada tahun 2018-2022, selanjuta Bapak Kamilin, S.Ag (alm) pada tahun  2022, dilanjukan oleh Bapak Rahmadi, M.Pd. (alm) pada tahun 2023, selanjutnya ada Plt Kepala MIN 2 Pulang Pisau, Bapak Mas’at,S.Pd. I dan Ibu Kartinah, S.Pd.I. pada tahun 2024

Kemudian pada tanggal 18 Desember 2024, dilaksanakan pelantikan Bapak Abdul Hamid, M.Pd.I sebagai Kepala MIN 2 Pulang Pisau,  oleh Bapak Kepala Kantor Kementerian Agama Kab. Pulang Pisau, Dr.H. Amrudin, M.Pd.

MIN 2 Pulang Pisau telah mendapatkan Akreditasi A dari Badan Akreditasu Nasional Pendidikan Anak Usia Dini, Pendidikan Dasar dan Pendidikan Menengah sesuai Keputusan Nomor : 017/BAN-PDM/SK/2025